No ano de 2552, os humanos do planeta Madrigal lutaram pela independência da Terra, mas um encontro fatal com o Alien Covenant complica as coisas. Master Chief John 117 e seu super soldado "Spartans" se juntam à luta. Após a batalha, Master Chief segue para seu planeta natal, Reach, com um sobrevivente de Madrigal e um objeto misterioso que ele descobriu no planeta. Mas uma ordem controversa faz John questionar sua missão e a si mesmo.